Бактериолошката загаденост на водата од горе наведените предпоставки директно го загрозува опстанокот на Протеус Ангиниус Олм ( триножец, тритон вид саламандер ) кој често се наоѓа во длабочините на подводната пештера. Истот така популацијата на Салмон Трутта Мацедоникус (Пастрмка Поточарка) е забележливо намален, но тоа се должи на незаконското ловење на истата а и во голема мера се должи на постојаната вариација на нивото на водата во езерото Матка за потребите на компаниите за производство на ел.енергија, со што се попречува мрестот на рибата во езерото. СНК Врело спроведува неколку пати во годината еко акции за расчистување на езерото од мрежи и останат отпад . Во дискусиа со еколошки друштва од земјава во врска со
резултатите од мониторингот СНК Врело дојде до идеја и се припрема во наредните години да изврши детално истражување за можноста мрестот на пастрмката да се одвива во подводната пештера поради константната вариација на нивото на водата во езерото Матка.
По инцијатива на Д-р Мaријан Темовски, за изработка на студија за настанокот на подводната пештера Врело, СНК Врело наскоро ќе почне со прибирање на примероци од Сала Пеони која се наоѓа на 150м хоризонтално од влезот на пештерата. Ова е воздушен џеб во пештерата преполн со карстни делови, сталагмити и сталактити. Визуелно наликува на сувата пештера Туристичка, но посебната убавина во салата е водниот дел, кој е кристално чиста. Резултатите од студијата се очекува да привлечат внимани на голем број научници од светот. Воедно Д-р Мријан Темовски во соработка со СНК Врело ќе направи проценка на деградација на целиот пештерски систем вклучувајќи ги трите суви пештери во непоследна близина. Проценката на деградацијата на пештерите во Кањонот Матка може да биде предизвик поради различните штетни активности: експлоатација на минерални суровини, туризам без надзор, развој на патната мрежа, навредливо уништување на шумите итн.
Спелеонуркачкиот клуб Врело од Скопје е присутен и активно зема учество во заштитата и промоцијата на убавините на Кањонот Матка , езерото, пештерите и живиот свет и ги нуди сите свои експертизи, ресурси и контакти за да придонесе за популарноста на оваа уникатна локација, да ја зачува убавината на својот биодиверзитет. Мора да се напомене дека државата и надлежните институции во изминатве години не посветуваа доволно внимание и грижа за Споменикот на Природата Кањонот Матка и убавините кои ги поседува. Со надеж дека работите ќе земат поинаков тек во иднина, СНК Врело несебично стои на располагање со сите свои ресурси и заедно со сите релевантни институции и организации ќе продолжи да се бори за зачувување и адекватна промоција на Кањонот Матка и подводната пештера Врело.